Дополнение «Fallout: Атомные узы» позволяет игрокам превратить все сценарии из базовой игры Fallout и дополнения «Новая Калифорния» в кооперативные. В кооперативных сценариях игроки совместно пытаются выполнить общую цель.
Более того, в этом дополнении в игру добавлены: модификации, которые можно использовать для улучшения оружия и предметов; мутации, которые могут как помочь, так и навредить тем, кто получил слишком большую дозу радиации; кубик помощи, позволяющий игрокам помогать друг другу в бою.